More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0719 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  79.84 
 
 
387 aa  646    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  100 
 
 
388 aa  765    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  100 
 
 
388 aa  765    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 
390 aa  322  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  41.47 
 
 
400 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  40 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  40.58 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  38.64 
 
 
387 aa  252  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  40.26 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  40.26 
 
 
400 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  40.26 
 
 
400 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  39.74 
 
 
400 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  39.74 
 
 
400 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  40 
 
 
400 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  40 
 
 
400 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  34.18 
 
 
398 aa  234  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
387 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
389 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
392 aa  156  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.35 
 
 
391 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.25 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
398 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.47 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  23.92 
 
 
426 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  23.57 
 
 
416 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.54 
 
 
401 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.28 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  25.92 
 
 
395 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  25 
 
 
428 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.63 
 
 
412 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.28 
 
 
407 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.5 
 
 
396 aa  107  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  23.02 
 
 
428 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  26.61 
 
 
419 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  27.52 
 
 
414 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  26.95 
 
 
424 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.52 
 
 
414 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  26.95 
 
 
399 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  26.95 
 
 
424 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  24.79 
 
 
397 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 
394 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  31.98 
 
 
406 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
408 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  27.02 
 
 
406 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.25 
 
 
408 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.25 
 
 
444 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  25.14 
 
 
405 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
413 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.92 
 
 
409 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  29.1 
 
 
415 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.33 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  23.96 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
413 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  24.23 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  22.89 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  23.42 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  27.53 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  24.37 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  25.77 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  21.51 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  22.62 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  34.16 
 
 
406 aa  97.1  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  27.25 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  24.86 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  23.38 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  23.38 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  23.38 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
430 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.26 
 
 
397 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
398 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  24.25 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  21.9 
 
 
398 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  24.24 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.4 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  26.37 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.93 
 
 
417 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  22.28 
 
 
424 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  27.06 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  22.46 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  24.94 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  23.68 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.68 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>