More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0422 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  767    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  27.88 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  28.57 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  29.34 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.26 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.26 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  28.07 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.2 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.46 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 425 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.89 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.27 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.7 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.7 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.7 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  25.7 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  25.7 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  31.22 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.39 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.39 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.31 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.39 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.4 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.08 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.49 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.28 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  35 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  28.89 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>