More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1111 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  877    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  76.32 
 
 		 424 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  78.86 
 
 		 423 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  79.38 
 
 		 424 aa  655    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  71.26 
 
 		 421 aa  588  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  70.62 
 
 		 425 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  71.77 
 
 		 417 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 386 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 398 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 426 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  28.05 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 416 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 397 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.29 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  29.49 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 421 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  29.92 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  29.46 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.12 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  30 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  30.56 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.77 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  26.61 
 
 		 399 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  30.43 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  26.61 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  26.61 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  30 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 406 aa  133  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.11 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.49 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.89 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  26.11 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  28.16 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  29.95 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  27.49 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  29.55 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  27.78 
 
 		 449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  28.16 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  28.16 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  27.74 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  28.16 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  27.74 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.78 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.68 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  27.74 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  27.74 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>