More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3044 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1859  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  33.25 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 405 aa  186  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 426 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  30.57 
 
 		 411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 416 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  30.29 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  29.71 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  33.52 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.97 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.75 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  28.67 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  30 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 419 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  28.84 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  30.41 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 407 aa  126  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  29.56 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 399 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.4 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  27.4 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  28.77 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  28.77 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  28.12 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  29.44 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  28.97 
 
 		 434 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  27.08 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.35 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  27.6 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 421 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  27.72 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.49 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  28.28 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  30.83 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  27.86 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  27.6 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>