More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1706 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 408 aa  249  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 419 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 421 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 428 aa  226  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 407 aa  226  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 414 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  36.91 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0271  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0305  multidrug resistance protein  40.27 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1119  multidrug resistance protein  40.27 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510833  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0121  multidrug resistance protein  40.27 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369056  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1290  multidrug resistance protein  40.27 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.800676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1708  multidrug resistance protein  40.27 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.477199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1794  multidrug resistance protein  40.27 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  34.11 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  33.09 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  33.59 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  33.94 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  35.9 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 427 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  37.19 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 415 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 397 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  31.52 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  33.82 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  34.55 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  31.88 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  34.74 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  32.77 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.85 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 397 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  31.17 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  30.77 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  30.12 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1444  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  28.5 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.45 
 
 		 424 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.46 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49750  MFS family transporter  33.79 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.51 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  29.15 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1598  transporter, major facilitator superfamily and tetracycline resistance protein  24.66 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.61 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>