270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0813 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  100 
 
 		 449 aa  887    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  57.35 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  29.12 
 
 		 411 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  29.59 
 
 		 411 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  29.4 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  30.54 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  29.21 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.7 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.21 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 411 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  27.76 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.52 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  25.83 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1788  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.53 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.27 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.02 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  26.21 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 397 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  26.18 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  26.61 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  23.74 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  23.4 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 412 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  27 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 421 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 416 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  24.94 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.09 
 
 		 370 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  24.26 
 
 		 399 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 398 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 395 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  27.37 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.37 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.44 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.779737  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.86 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4548  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  24.25 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.94 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  24.48 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>