More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1716 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  98.79 
 
 		 413 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 413 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  98.06 
 
 		 413 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  99.76 
 
 		 413 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1859  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1791  major facilitator superfamily MFS_1  97.96 
 
 		 99 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.440711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.5 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.93 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.58 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  24.4 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.74 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.45 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  23.91 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.71 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.54 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.07 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  27.09 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  26.79 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  27.09 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 411 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.56 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.89 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.89 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.18 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.25 
 
 		 370 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.73 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 398 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  24.82 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  24.88 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.68 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  26.76 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  25.12 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  25.12 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  28.92 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  24.88 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  24.88 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  24.88 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  24.57 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  25.58 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  24.88 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 400 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  27.37 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>