More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0314 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  750    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  71.47 
 
 
394 aa  494  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  52.15 
 
 
416 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  35.38 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
392 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  31.41 
 
 
449 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 
387 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4959  major facilitator transporter  35.77 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592693  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
389 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  32.87 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  27.62 
 
 
399 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  33.16 
 
 
391 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
425 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  32.01 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  35.16 
 
 
398 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  31.9 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
398 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  34.22 
 
 
386 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  30.43 
 
 
442 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  31.83 
 
 
426 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
408 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  27.3 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  32.6 
 
 
403 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
434 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.15 
 
 
416 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.4 
 
 
444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.76 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  33.42 
 
 
415 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.14 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  30.67 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.25 
 
 
414 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  33.15 
 
 
412 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  29.06 
 
 
419 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  30.41 
 
 
397 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  32.88 
 
 
403 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  27.9 
 
 
424 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
408 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
390 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
428 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  27.25 
 
 
406 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  29.34 
 
 
421 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  29.29 
 
 
442 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
430 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  28.06 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.76 
 
 
428 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  29.34 
 
 
440 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28.19 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.47 
 
 
408 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  31.44 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  30.62 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  29.12 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.8 
 
 
411 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
411 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.86 
 
 
422 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2885  major facilitator transporter  30.62 
 
 
409 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.281553  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  29.35 
 
 
415 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  30.85 
 
 
434 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  28.71 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  29.32 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  30.58 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  28.3 
 
 
412 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
407 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  29.63 
 
 
406 aa  113  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.39 
 
 
411 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  28.42 
 
 
424 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  28.68 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  29.48 
 
 
435 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  28.49 
 
 
396 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  28.42 
 
 
424 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  28.42 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  27.92 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  28.25 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  31.15 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  28.08 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2388  major facilitator transporter  31.78 
 
 
400 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  25.74 
 
 
398 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  29.22 
 
 
405 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
398 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.16 
 
 
399 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
396 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  27.93 
 
 
406 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
401 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.42 
 
 
423 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
453 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.14 
 
 
422 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.07 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>