More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1277 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 433 aa  852    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  73.3 
 
 		 433 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  73.3 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  72.6 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  63.51 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  61.81 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  61.83 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  58 
 
 		 430 aa  508  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  51.83 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 438 aa  359  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 464 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  35.57 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  35.1 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  35.21 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 452 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1527  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 		 407 aa  236  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  32.88 
 
 		 462 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  32.88 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  32.51 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  32.73 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 455 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 454 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 454 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 456 aa  229  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  32.51 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  32.51 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 453 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  32.29 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  32.29 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 454 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 462 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  33.03 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  31.89 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  32.12 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  31.89 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  32.81 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  31.89 
 
 		 454 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  35.79 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  36 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 385 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  35.22 
 
 		 458 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00225  transporter, putative  34.36 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 462 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  33.59 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  35.45 
 
 		 456 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 455 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  35.83 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  33.16 
 
 		 387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>