More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3877 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  78.66 
 
 		 464 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  78.23 
 
 		 464 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  77.59 
 
 		 464 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  79.44 
 
 		 465 aa  730    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  78.45 
 
 		 464 aa  695    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  78.88 
 
 		 464 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  79.82 
 
 		 454 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  100 
 
 		 464 aa  905    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  78.66 
 
 		 464 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  79.96 
 
 		 462 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  81.92 
 
 		 462 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  55.38 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  55.38 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  55.38 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  55.88 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  58.15 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  54.65 
 
 		 454 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  54.41 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  54.41 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  54.41 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  54.41 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  52.86 
 
 		 455 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  54.07 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  53.63 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  54.07 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  53.85 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  53.74 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  53.63 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  51.32 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  52.09 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  53.93 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  53.24 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  48.42 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  53.91 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  44.35 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  44.35 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  48.03 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  49.45 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  49.23 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  48.9 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  47.48 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  50.45 
 
 		 455 aa  363  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  41.06 
 
 		 455 aa  363  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  48.98 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  48.37 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  40.62 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  44.57 
 
 		 454 aa  355  8.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  47.05 
 
 		 455 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  46.61 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1684  sugar efflux MFS family transporter  43.52 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1959  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 454 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00498964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  50 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 395 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 394 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 387 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 385 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0955  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.903849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0813  major facilitator family transporter  44.29 
 
 		 465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 395 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  46.68 
 
 		 478 aa  299  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 418 aa  299  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  46.68 
 
 		 490 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2747  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  46.68 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  46.68 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1993  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 454 aa  294  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256386  decreased coverage  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  46.53 
 
 		 385 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  46.53 
 
 		 385 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  46.53 
 
 		 385 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  46.53 
 
 		 385 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>