More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0922 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  100 
 
 
454 aa  904    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  55.95 
 
 
455 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  54.63 
 
 
455 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  54.85 
 
 
455 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  54.85 
 
 
455 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  54.85 
 
 
455 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  54.19 
 
 
455 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  54.85 
 
 
455 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  54.41 
 
 
455 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  55.07 
 
 
455 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  53.96 
 
 
455 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  54.41 
 
 
455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  54.41 
 
 
455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  54.41 
 
 
455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  53.52 
 
 
455 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  53.52 
 
 
455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  51.24 
 
 
455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  53.96 
 
 
455 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  48.99 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  44.72 
 
 
464 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  44.72 
 
 
464 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  45.62 
 
 
462 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  44.17 
 
 
465 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  41.78 
 
 
454 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  46.74 
 
 
464 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  42.22 
 
 
454 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  42.22 
 
 
454 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  42.22 
 
 
454 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  42 
 
 
454 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  41.78 
 
 
454 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  42.22 
 
 
454 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  41.78 
 
 
454 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  41.78 
 
 
454 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  41.78 
 
 
454 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  41.96 
 
 
454 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  44.94 
 
 
472 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  42.02 
 
 
453 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  44.74 
 
 
460 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  46.52 
 
 
464 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  41.96 
 
 
454 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  41.39 
 
 
454 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  41.96 
 
 
456 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 
454 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  46.29 
 
 
464 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  43.02 
 
 
461 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  45.62 
 
 
464 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  41.61 
 
 
454 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  43.54 
 
 
462 aa  363  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  41.16 
 
 
454 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  44.62 
 
 
454 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 
454 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  42.05 
 
 
458 aa  353  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 
454 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0147  major facilitator transporter  47.65 
 
 
447 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00532469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  43.56 
 
 
453 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 
457 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  41.36 
 
 
454 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00225  transporter, putative  43.43 
 
 
442 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  44.57 
 
 
464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  42.7 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  44.97 
 
 
462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  45.19 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  40.37 
 
 
455 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  43.68 
 
 
456 aa  324  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  39.68 
 
 
455 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 
462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1959  major facilitator transporter  39.95 
 
 
454 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00498964  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1684  sugar efflux MFS family transporter  39.28 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  47.12 
 
 
407 aa  309  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 
401 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 
387 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  42.82 
 
 
395 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 
394 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  39.82 
 
 
458 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  39.59 
 
 
458 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  38.69 
 
 
469 aa  291  2e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  44.53 
 
 
387 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  41.93 
 
 
395 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  41.03 
 
 
395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  41.41 
 
 
385 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  41.15 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  41.15 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  41.15 
 
 
385 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  40.67 
 
 
418 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  38.34 
 
 
452 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  41.21 
 
 
385 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  42.01 
 
 
478 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2747  major facilitator transporter  44.47 
 
 
406 aa  272  8.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  40.77 
 
 
395 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1993  major facilitator transporter  40.04 
 
 
454 aa  269  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256386  decreased coverage  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  40.87 
 
 
416 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>