More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3773 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  800    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4567  major facilitator transporter  72.29 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  69.61 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3821  major facilitator superfamily transporter  69.77 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4065  major facilitator superfamily transporter  69.87 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0295  major facilitator superfamily transporter  66.32 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  64.94 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  54.87 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4711  major facilitator superfamily transporter  68.5 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  51.55 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  52.16 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  52.07 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  51.17 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  51.17 
 
 		 387 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  51.39 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  53.73 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 418 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  51.69 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4107  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.69 
 
 		 385 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  56.94 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  50.66 
 
 		 490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  53.81 
 
 		 416 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1904  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  45.27 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  47.57 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 455 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  45.04 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  43.94 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  46.15 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  44.76 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 464 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  40 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  40 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  40 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  38.86 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  43.7 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 457 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  38.86 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 464 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  38.86 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  38.96 
 
 		 454 aa  269  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  44.16 
 
 		 455 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 455 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  38.86 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  44.13 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  38.61 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  38.61 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 464 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  38.61 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  43.94 
 
 		 471 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  38.37 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  41.97 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  41.71 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 462 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  40.87 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>