More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0296 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  100 
 
 		 411 aa  811    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  52.47 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 		 395 aa  306  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  25.69 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.73 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.73 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.47 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0679  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.695505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  34.44 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.25 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  20.82 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.9 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.89 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  21.71 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  23.28 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.04 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  23.28 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  23.28 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.97 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.05 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.69 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.95 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.93 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.56 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.45 
 
 		 506 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 395 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  21.97 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  24.69 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  25 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 502 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.28 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  23.28 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.28 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  28.76 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.72 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  25 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.63 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  22.99 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>