More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0806 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  88.75 
 
 		 399 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  773    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  56.75 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 		 406 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  49.2 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  26.98 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.82 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 387 aa  99.8  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.88 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.41 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.66 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.37 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.47 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 466 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.17 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.14 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  28.95 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  27.32 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  30.36 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.28 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  28.49 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  26.96 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  25.82 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  33.21 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.25 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  26.07 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  31 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  24.37 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.03 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.4 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.4 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>