More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1620 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  843    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  57.4 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  49.24 
 
 		 395 aa  352  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 395 aa  310  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  28.99 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  28.99 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  28.99 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  28.72 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  30.46 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  28.79 
 
 		 381 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  30.57 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  30.36 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  30.29 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  30.46 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  30.57 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  30.46 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  28.79 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  30.37 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  30.37 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 401 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  26.05 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  26.05 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.93 
 
 		 409 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.93 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.85 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.9 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  24.52 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  24.56 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  24.56 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  24.56 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1601  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  24.31 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  24 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  25.08 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  25.74 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.55 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  25.63 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.11 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  23.44 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.4 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  21.85 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.51 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.64 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.51 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>