283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0859 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  100 
 
 
392 aa  772    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  72.51 
 
 
402 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  34.63 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  35.92 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  35.66 
 
 
399 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  35.4 
 
 
399 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  36.08 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  35.4 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  35.82 
 
 
399 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  35.14 
 
 
399 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  35.82 
 
 
399 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  35.82 
 
 
399 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  35.82 
 
 
399 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  29.4 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  30.87 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  29.4 
 
 
396 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
400 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  27.9 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  27.9 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  27.13 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  27.9 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.2 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  27.7 
 
 
506 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  27.7 
 
 
400 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  26.87 
 
 
400 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  27.9 
 
 
396 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  27.25 
 
 
506 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  27.18 
 
 
399 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  27.18 
 
 
505 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  27.46 
 
 
401 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  27.69 
 
 
400 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  26.14 
 
 
403 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  26.14 
 
 
403 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
396 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  27.47 
 
 
397 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
391 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  26.72 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.76 
 
 
381 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
421 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  30.99 
 
 
410 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.76 
 
 
381 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  28.4 
 
 
405 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
381 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.48 
 
 
384 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.9 
 
 
381 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
404 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.34 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  23.96 
 
 
400 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.42 
 
 
402 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
410 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
415 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
396 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  26.86 
 
 
386 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.36 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.72 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  27.23 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.53 
 
 
411 aa  97.1  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
419 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
410 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  26.3 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
395 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.55 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  20.97 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  25.06 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.51 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  24.23 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  24.23 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  24.23 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  24.23 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.29 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  26.09 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  23.26 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  24.93 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  26.79 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  24.1 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  23.94 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  24.2 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  23.94 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  25.76 
 
 
408 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  23.94 
 
 
416 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  23.94 
 
 
405 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  23.94 
 
 
405 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.86 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  23.94 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  23.94 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>