More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0161 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 392 aa  767    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  49.62 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  40.05 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  39.18 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  36.75 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  35.73 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  35.48 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 421 aa  249  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  34.96 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  34.96 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  34.96 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  35.22 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  33.95 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  35.26 
 
 		 396 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  35 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  35 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  34.74 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  33.95 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  30.94 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  30.1 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  30.1 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  29.85 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  29.08 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  32.38 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  31.73 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  32.11 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  29.08 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  29.08 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  29.08 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  32.23 
 
 		 506 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  29.08 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  32.23 
 
 		 506 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 505 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 447 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  29.61 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  27.3 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  31.11 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  27.71 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  26.53 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.73 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 415 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 410 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  27.1 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  27.1 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.13 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  26.79 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  26.48 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  26.48 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  26.96 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  26.48 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  26.73 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  26.73 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.38 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  21.92 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>