185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2538 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  788    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  788    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  77.32 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 384 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  25.13 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.88 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.73 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.89 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  25.27 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  21.28 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.15 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0202  hypothetical protein  20.49 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0349216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  21.35 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.01 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  21.22 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  21.88 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  21.17 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  21.88 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  21.22 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  26.61 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  21.51 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.22 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  21.58 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.8 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  20.4 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  21.49 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  21.49 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  26.18 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  21.02 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  26.29 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  26.29 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  26.29 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  21.87 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  20.13 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  22.54 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  25.66 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1021  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.394996  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  23.04 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  21.87 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  19.68 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  22.04 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1651  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  20.9 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  21.26 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  21.09 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  22.4 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  21.09 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  21.09 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  21.09 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  21.09 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2013  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.36 
 
 		 511 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  21.6 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>