More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3286 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
395 aa  792    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 
396 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  52.3 
 
 
408 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  49.24 
 
 
419 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  52.93 
 
 
395 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  30.48 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  31.02 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
381 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  30.21 
 
 
381 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
381 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  31.33 
 
 
399 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  30.54 
 
 
381 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
391 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  29.68 
 
 
381 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  30.14 
 
 
400 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  29.57 
 
 
506 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  29.86 
 
 
400 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  29.57 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  29.57 
 
 
447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  29.28 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  29.57 
 
 
400 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  27.78 
 
 
400 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
396 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
401 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  29.57 
 
 
505 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  29.57 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  30.21 
 
 
399 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  31.11 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  30.45 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  30.45 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  30.2 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  30.83 
 
 
399 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  31.11 
 
 
399 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  30.3 
 
 
409 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  31.11 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
415 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  28.92 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.17 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  29.02 
 
 
402 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  24.22 
 
 
405 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  24.22 
 
 
396 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  24.22 
 
 
396 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  24.22 
 
 
396 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.62 
 
 
387 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
387 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  27.64 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  23.32 
 
 
396 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  25.64 
 
 
392 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  28.41 
 
 
392 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  23.32 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  26.52 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  26.57 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  25.08 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  25.23 
 
 
370 aa  93.2  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
410 aa  92.8  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  22.57 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
435 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  25.17 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.17 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.56 
 
 
386 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  25.43 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  25.5 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  28.39 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  27.36 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.28 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  25.23 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  22.62 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  22.62 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  24.65 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.19 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  25.93 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.15 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  24.15 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  23.37 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.44 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.3 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  22.9 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.08 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.08 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.15 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  26.24 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>