More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1601 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1601  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
394 aa  780    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  30.08 
 
 
386 aa  135  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0162  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 
415 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.02 
 
 
447 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.9 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.49 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.75 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.49 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.98 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.18 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.64 
 
 
506 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.75 
 
 
400 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.66 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.35 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.22 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.94 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.94 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  23.17 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.66 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.66 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  23.38 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  21.76 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.55 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  23.1 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  21.86 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.8 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.45 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.73 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  26.28 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.45 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.11 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.45 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.23 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  21.35 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.72 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  21.52 
 
 
409 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  22.63 
 
 
446 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
621 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.32 
 
 
495 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04840  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 
401 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  35.09 
 
 
487 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  25.08 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  21.58 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.18 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
497 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.33 
 
 
517 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  26.84 
 
 
467 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.74 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  25.61 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  28.16 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  24.59 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  25.19 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  26.47 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  23.77 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  25.61 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  28.1 
 
 
486 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  24.19 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
489 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.74 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  22.88 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  22.69 
 
 
436 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.45 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  23.77 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  23.77 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  23.19 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  23.19 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  23.19 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0384  bicyclomycin resistance protein  27.54 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  24.8 
 
 
507 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  20.56 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 
495 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  23.19 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  30 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.84 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 
495 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>