More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1418 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  88.69 
 
 		 408 aa  703    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  88.69 
 
 		 406 aa  703    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  88.69 
 
 		 408 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  95.05 
 
 		 406 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  96.05 
 
 		 420 aa  789    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  88.69 
 
 		 408 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  99.26 
 
 		 406 aa  808    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  87.68 
 
 		 408 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  80.2 
 
 		 406 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  80.69 
 
 		 406 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  95.81 
 
 		 406 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  88.69 
 
 		 408 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  95.81 
 
 		 406 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  88.44 
 
 		 408 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  88.69 
 
 		 408 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  95.81 
 
 		 406 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  78.71 
 
 		 407 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  65.29 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  64.29 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  55.58 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  56.84 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  50.26 
 
 		 422 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  47.15 
 
 		 430 aa  332  8e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  42.86 
 
 		 542 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  34.65 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  37.24 
 
 		 495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  34.34 
 
 		 514 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  39.81 
 
 		 547 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  32.86 
 
 		 520 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  29.28 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  29.28 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  29.28 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 409 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 409 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  27.51 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  27.51 
 
 		 510 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  27.51 
 
 		 510 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.77 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.77 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.77 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  27.29 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  27 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  27 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  27.25 
 
 		 495 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  26.75 
 
 		 496 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  26.75 
 
 		 496 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  26.75 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  26.75 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  26.75 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  26.75 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  30.23 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 491 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  26.5 
 
 		 496 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 415 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  28.5 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 482 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 420 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  28.26 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  34.87 
 
 		 496 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  34.87 
 
 		 496 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  34.87 
 
 		 496 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  34.87 
 
 		 496 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  28.09 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>