More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0396 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  99.76 
 
 
417 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  99.52 
 
 
417 aa  836    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  99.52 
 
 
417 aa  836    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  72.39 
 
 
410 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  71.85 
 
 
403 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  58.15 
 
 
408 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  58.15 
 
 
406 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  58.15 
 
 
408 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  58.15 
 
 
408 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  58.15 
 
 
408 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  55.84 
 
 
406 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  57.61 
 
 
408 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  58.15 
 
 
408 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  58.15 
 
 
408 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  56.31 
 
 
406 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  56.31 
 
 
406 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  56.31 
 
 
406 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  55.56 
 
 
420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  55.58 
 
 
406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  55.58 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  55.33 
 
 
406 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 
406 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  54.57 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 
416 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 
416 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  45.01 
 
 
407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  42.11 
 
 
422 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  37.47 
 
 
542 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  36.74 
 
 
493 aa  256  4e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  35.75 
 
 
514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  35.08 
 
 
495 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  38.05 
 
 
547 aa  203  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  31.45 
 
 
520 aa  193  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  33.49 
 
 
431 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  29.69 
 
 
395 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.299198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.94 
 
 
405 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.94 
 
 
405 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.94 
 
 
405 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  24.71 
 
 
496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  24.71 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  24.71 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  24.71 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  24.49 
 
 
496 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  24.45 
 
 
496 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  24.45 
 
 
496 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  27.81 
 
 
491 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  29.41 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  27.88 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  27.88 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  28.13 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  24.44 
 
 
495 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  28.94 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  27.36 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  28.94 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  27.75 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  26.56 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.56 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  24.28 
 
 
510 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  24.28 
 
 
510 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  24.28 
 
 
510 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  27.44 
 
 
425 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.44 
 
 
425 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.37 
 
 
429 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.97 
 
 
411 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
432 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  26.11 
 
 
415 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.3 
 
 
428 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  26.29 
 
 
418 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  27.59 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
482 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  28.16 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  26.88 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.67 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.14 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.43 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  25.69 
 
 
429 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  27.69 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  27.88 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  27.34 
 
 
458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  27.6 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  28.47 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  28.65 
 
 
408 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
428 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  25.85 
 
 
420 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
428 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>