More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3722 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  100 
 
 		 405 aa  806    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  100 
 
 		 405 aa  806    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  806    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  57.39 
 
 		 426 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  57.39 
 
 		 426 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  57.14 
 
 		 426 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  37.14 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  37.14 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  37.14 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  35.18 
 
 		 496 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  35.18 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  288  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  288  9e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  34.96 
 
 		 496 aa  288  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  34.96 
 
 		 496 aa  288  9e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  34.73 
 
 		 496 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  34.73 
 
 		 496 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  35.25 
 
 		 495 aa  285  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  34.73 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 482 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.34 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  29.97 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  29.72 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.33 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 416 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 406 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  30 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  28.94 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 432 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 420 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 420 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  26.89 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  28.54 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.01 
 
 		 399 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.73 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4365  cis,cis-muconate transporter MucK  27.02 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  27.27 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>