More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1227 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  99.53 
 
 		 426 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  100 
 
 		 426 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  100 
 
 		 426 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  57.39 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  57.39 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  57.39 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  35.93 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  34.42 
 
 		 496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  34.85 
 
 		 496 aa  272  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  34.85 
 
 		 496 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  34.42 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  34.42 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  34.42 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  34.42 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  34.63 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  34.63 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  34.63 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  34.63 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  34.63 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  34.63 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  34.42 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  36.09 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  36.09 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  36.09 
 
 		 510 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 482 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  29.82 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 406 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  28.33 
 
 		 418 aa  152  8.999999999999999e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.71 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  30.19 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.46 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.47 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.47 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.47 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.47 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.73 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.73 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  30.11 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.46 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 491 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.88 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.61 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  30.11 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  27.88 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  29.83 
 
 		 418 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  25.97 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  26.3 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  28.05 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>