More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1032 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  87.68 
 
 
406 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  100 
 
 
406 aa  816    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  100 
 
 
408 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  87.87 
 
 
420 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  94.85 
 
 
408 aa  770    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  82.21 
 
 
406 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  100 
 
 
408 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  100 
 
 
408 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  100 
 
 
408 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  88.19 
 
 
406 aa  713    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  87.68 
 
 
406 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  100 
 
 
408 aa  820    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  99.75 
 
 
408 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  82.21 
 
 
406 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  88.69 
 
 
406 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  88.94 
 
 
406 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  87.68 
 
 
406 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  78.7 
 
 
407 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  58.15 
 
 
417 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  58.15 
 
 
417 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  58.15 
 
 
417 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  58.15 
 
 
417 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  58.15 
 
 
417 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  62 
 
 
416 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  60.75 
 
 
416 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  60.1 
 
 
410 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  58.98 
 
 
403 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  47.21 
 
 
407 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  48.41 
 
 
422 aa  348  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 
430 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  40.97 
 
 
542 aa  278  8e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  34.9 
 
 
493 aa  256  5e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  38.8 
 
 
495 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  35.34 
 
 
514 aa  239  9e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  40.45 
 
 
547 aa  217  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  37.15 
 
 
431 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  33.57 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
411 aa  176  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  31.01 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  28.54 
 
 
510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  28.33 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  28.33 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  30.64 
 
 
411 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  28.61 
 
 
429 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  27.56 
 
 
496 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  27.56 
 
 
496 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.33 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.33 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  26.89 
 
 
496 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  27.33 
 
 
496 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.33 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  29.36 
 
 
429 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  27.33 
 
 
496 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  27.33 
 
 
496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  27.33 
 
 
496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  27.33 
 
 
496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  27.33 
 
 
496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  31.83 
 
 
409 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  31.83 
 
 
409 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  28.68 
 
 
426 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  28.47 
 
 
426 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
430 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  28.47 
 
 
426 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  29.55 
 
 
418 aa  153  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  26.75 
 
 
495 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  31.43 
 
 
425 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  31.43 
 
 
425 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  28.11 
 
 
395 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  31.47 
 
 
436 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.72 
 
 
415 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  30.37 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.61 
 
 
420 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
482 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  28.07 
 
 
420 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  30.27 
 
 
433 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  27.83 
 
 
428 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  30.51 
 
 
435 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
432 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  30.19 
 
 
432 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.37 
 
 
420 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
433 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
433 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  27.83 
 
 
445 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.37 
 
 
420 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  29.51 
 
 
474 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.37 
 
 
420 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  27.59 
 
 
445 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.95 
 
 
432 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  32.31 
 
 
402 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  28.39 
 
 
491 aa  143  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  32.75 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.78 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  29.02 
 
 
474 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  27.57 
 
 
428 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  29.27 
 
 
474 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.43 
 
 
433 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>