More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0255 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  778    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  29.69 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  27.43 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.43 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  27.43 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.43 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.43 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.43 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.43 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 403 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  28.5 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  28.5 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  28.5 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  28.73 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25.77 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25.77 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25.77 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 409 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 491 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  24.7 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  24.7 
 
 		 510 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  24.7 
 
 		 510 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  25.5 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  23.29 
 
 		 542 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  26.72 
 
 		 418 aa  93.6  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 432 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 428 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 432 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 428 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  25.5 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  27.13 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 447 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  25.61 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.36 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>