More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2375 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  834    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  28.98 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  30.86 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  30.35 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  31.62 
 
 		 439 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  31.52 
 
 		 437 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  31.94 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  31.12 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  31.09 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.94 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.79 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.43 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  31.69 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  31.69 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  30.99 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  31.69 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  31.66 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  31.66 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.29 
 
 		 459 aa  146  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  32.73 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  30.4 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  28.54 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.7 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  32.32 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  30.95 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  30.02 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  30.64 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.06 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.06 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  30.4 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  30.64 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  31.43 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  32.16 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0130  general substrate transporter  31.21 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.471024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  30.23 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1331  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  30.97 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  30.33 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  32.29 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.16 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  31.5 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  30.84 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  32.76 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  31.99 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  29.95 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  28.09 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  30.37 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  27.51 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  30 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  29.95 
 
 		 435 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 450 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  30.09 
 
 		 437 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 444 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  30.53 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 442 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  30.09 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>