More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3304 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  100 
 
 		 456 aa  903    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  70.88 
 
 		 467 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  61.31 
 
 		 444 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  60 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  59.77 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  60.47 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  60.89 
 
 		 444 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  60.14 
 
 		 458 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  54.08 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  49.89 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  49.89 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0464  general substrate transporter  57.04 
 
 		 436 aa  415  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  47.03 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  43.68 
 
 		 434 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  40.85 
 
 		 496 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  43.43 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  41.41 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  40.38 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  42.18 
 
 		 489 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  40.85 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  42.96 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  42.96 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  40.61 
 
 		 527 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  42.96 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  41.71 
 
 		 531 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  41.88 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  43.41 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  40.86 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 495 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 445 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  40.47 
 
 		 503 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  41.75 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  41.4 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  41.71 
 
 		 489 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  41.71 
 
 		 489 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  41.47 
 
 		 489 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  41.13 
 
 		 458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  39.95 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  40 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1246  General substrate transporter  43.85 
 
 		 440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 500 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 500 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  40.27 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 452 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  41.59 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  40.42 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  40.19 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  39.49 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 495 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 495 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 495 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  40.82 
 
 		 501 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 495 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  44.12 
 
 		 445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  39.25 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  39.25 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  40.27 
 
 		 500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  39.25 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  42.52 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 628 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  38.79 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  38.79 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.79 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  38.79 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  38.79 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  43.41 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  41.57 
 
 		 626 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  38.79 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  43.41 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  38.24 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  43.41 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  38.32 
 
 		 500 aa  315  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  38.32 
 
 		 500 aa  315  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  41.11 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  41.43 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  41.43 
 
 		 489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  44.63 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.47 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  43.5 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  39.69 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  39.18 
 
 		 450 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  39.62 
 
 		 485 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  39.62 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  39.62 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  38.64 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>