More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3486 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  100 
 
 		 439 aa  868    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 433 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  38.73 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  40.19 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  38.25 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  39.9 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.23 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.47 
 
 		 430 aa  292  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  39.86 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  39.71 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  39.22 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  39.71 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  39.46 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  37.83 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  40.14 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  40.14 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.33 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  39.46 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  39.46 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  37.83 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.33 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.33 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  39.22 
 
 		 440 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  39.15 
 
 		 447 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  37.41 
 
 		 450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  37.41 
 
 		 450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  37.41 
 
 		 450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  37.41 
 
 		 450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  37.41 
 
 		 450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  38.86 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  37.41 
 
 		 634 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  38.17 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  38.21 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  38.85 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.32 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  37.08 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  39.21 
 
 		 439 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  38.1 
 
 		 432 aa  272  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  37.27 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  38.04 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  40.05 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  38.13 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 438 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1191  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0421509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  38.42 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  38.93 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  38.24 
 
 		 439 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  38.06 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  38.06 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  38.06 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  38.06 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  38.06 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  37.47 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  38.06 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  37.65 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 436 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  38.44 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  35.7 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  36.3 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  36.3 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  36.3 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.11 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 447 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 449 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.89 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  35.61 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 445 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  38.42 
 
 		 432 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0329  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.79 
 
 		 442 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000181979  normal  0.0690464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1167  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181603  normal  0.0337638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  33.15 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 438 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.6 
 
 		 433 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 438 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  37.26 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 430 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 463 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 438 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.32 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>