More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0089 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  100 
 
 		 429 aa  854    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  59.57 
 
 		 431 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  56.41 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  53.97 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  53.5 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  53.74 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  53.32 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  48.02 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  47.52 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 429 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  46.99 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  46.29 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  47 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  47.41 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 435 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 445 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 462 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  45.6 
 
 		 442 aa  346  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 445 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  46.92 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.29 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  46.11 
 
 		 466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 436 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 465 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  41.75 
 
 		 476 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  41.75 
 
 		 476 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  42.31 
 
 		 448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 487 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  41.78 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  43.52 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  42.53 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  45.41 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  40.64 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 441 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  40.45 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  38.13 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  36.87 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  36.87 
 
 		 443 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  31.86 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  31.86 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  32 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.41 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.42 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 461 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  31.44 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  31.77 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  31.74 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  31.77 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  30.41 
 
 		 444 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  30.26 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 440 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  33.41 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  29.47 
 
 		 444 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  29.31 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>