More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0407 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 435 aa  858    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  43.2 
 
 		 420 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  39 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  38.13 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  38.16 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  38.48 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  38.33 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  37.2 
 
 		 444 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  38.29 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  37.96 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  37.96 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  37.16 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  37.68 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  37.71 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 443 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  36.63 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  37.16 
 
 		 485 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  35.99 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  37.16 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  37.16 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  37.16 
 
 		 485 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  35.75 
 
 		 489 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  36.93 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  36.93 
 
 		 485 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  36.93 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  36.93 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  36.93 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  37.07 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.03 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  37.23 
 
 		 552 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 438 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 438 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.96 
 
 		 433 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 438 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  37.83 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 438 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 495 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 443 aa  276  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  36.36 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  36.36 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  36.36 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  36.36 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  36.08 
 
 		 495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  35.9 
 
 		 503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  36.17 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  36.52 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 425 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  36.41 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  36.41 
 
 		 534 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  36.41 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  36.41 
 
 		 534 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  36.41 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  36.41 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  34.84 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  36.39 
 
 		 628 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  35.39 
 
 		 527 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  35.99 
 
 		 501 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  35.55 
 
 		 500 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  36.39 
 
 		 626 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  34.6 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  36.39 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  36.39 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  35.19 
 
 		 503 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4461  major facilitator family transporter  38.33 
 
 		 430 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  35.43 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6405  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  36.49 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 425 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  32.3 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.82 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 425 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 425 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  34.12 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  38.24 
 
 		 427 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  38.08 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  33.89 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1665  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  36.36 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5864  general substrate transporter  38.74 
 
 		 448 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256271  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  38.97 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>