More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2147 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  848    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  70.21 
 
 		 441 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  70.69 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  70.69 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  69.74 
 
 		 441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  70.34 
 
 		 446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  70.21 
 
 		 441 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  70.21 
 
 		 441 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  59.22 
 
 		 436 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  58.51 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  58.51 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  58.75 
 
 		 436 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  58.8 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  58.25 
 
 		 437 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  58.02 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  58.55 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  58.55 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  58.55 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  59.07 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  60.14 
 
 		 437 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  60.14 
 
 		 437 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  57.73 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  57.73 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  61.15 
 
 		 437 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  57.49 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  57.49 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  60.9 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  60.9 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  57.49 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  57.49 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  60.9 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  57.49 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  60.9 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  56.67 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  56.67 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  56.44 
 
 		 444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  56.21 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  56.67 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  56.67 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  56.67 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  56.44 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  56.76 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  52.22 
 
 		 524 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  52.88 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  51.2 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  49.18 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  45.98 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.24 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  42.82 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.18 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4036  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16141  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 481 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 439 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.16 
 
 		 437 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 470 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 470 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.46 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 438 aa  282  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  39.39 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.64 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.32 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.66 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.33 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.52 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  39.64 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  39.77 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  38.44 
 
 		 468 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.58 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3204  general substrate transporter  41.53 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  41.77 
 
 		 437 aa  269  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.26 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>