More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1540 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  73.13 
 
 		 470 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 468 aa  931    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  73.32 
 
 		 471 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  73.35 
 
 		 470 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  73.8 
 
 		 468 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  75.17 
 
 		 481 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  75.82 
 
 		 469 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  76.46 
 
 		 470 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  73.35 
 
 		 470 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  73.36 
 
 		 474 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  47.99 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  46.1 
 
 		 436 aa  352  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 436 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  45.93 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  44.2 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 437 aa  326  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  41.95 
 
 		 433 aa  322  8e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  42.71 
 
 		 524 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  42.23 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  42 
 
 		 443 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 444 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 457 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 457 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  42 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 439 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  41.76 
 
 		 443 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 437 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 437 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 446 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 441 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 441 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  43.07 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.79 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 450 aa  289  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.9 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.45 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.9 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  37.58 
 
 		 455 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 440 aa  280  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  40.15 
 
 		 434 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  40.15 
 
 		 435 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  39.9 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  39.77 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  39.9 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 446 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.6 
 
 		 435 aa  276  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  41.78 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.84 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.6 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.95 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  39.29 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.49 
 
 		 437 aa  273  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  40.09 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  39.02 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  39.02 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  39.02 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 439 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.95 
 
 		 468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.32 
 
 		 432 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>