More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8895 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  100 
 
 		 455 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  55.33 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  53.9 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.91 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  50.11 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  53.32 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  47.72 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  47.72 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  47.72 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  48.07 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  45.86 
 
 		 484 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  47.1 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  46.98 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  45.6 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  44.89 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  47.56 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  44.37 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  44.02 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.73 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 454 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  42.89 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 448 aa  322  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.89 
 
 		 468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.65 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.33 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.15 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.91 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.9 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40.24 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 445 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 442 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 439 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 439 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 439 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.65 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  40 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  40 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.33 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.03 
 
 		 437 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.24 
 
 		 441 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.56 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5957  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0570513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  39.32 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  39.32 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 451 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 465 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 460 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  38.78 
 
 		 439 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  39.08 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.02 
 
 		 447 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  40.52 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 463 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  39.08 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  41.65 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>