More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2701 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  99.55 
 
 
443 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  99.55 
 
 
443 aa  860    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  99.32 
 
 
443 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  93.23 
 
 
443 aa  790    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  86.51 
 
 
437 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  99.55 
 
 
443 aa  860    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  100 
 
 
443 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  84.54 
 
 
437 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  99.77 
 
 
443 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  99.55 
 
 
443 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  68.37 
 
 
436 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  66.91 
 
 
436 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  66.91 
 
 
436 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  63.79 
 
 
436 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  66.83 
 
 
436 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  66.83 
 
 
436 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  66.58 
 
 
436 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  66.58 
 
 
436 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  64.94 
 
 
439 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  67.91 
 
 
437 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
444 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
439 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  64.62 
 
 
434 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  67.91 
 
 
437 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  64.94 
 
 
457 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  68.09 
 
 
437 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  64.71 
 
 
444 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  68.09 
 
 
437 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  64.71 
 
 
457 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  64.71 
 
 
439 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  68.09 
 
 
437 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  68.09 
 
 
437 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  68.09 
 
 
437 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  64.71 
 
 
457 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  62.17 
 
 
524 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  61.89 
 
 
444 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  61.89 
 
 
444 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  61.89 
 
 
444 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  61.89 
 
 
444 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  61.89 
 
 
444 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  61.89 
 
 
444 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  61.89 
 
 
444 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  59.95 
 
 
433 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  56.16 
 
 
441 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  56.64 
 
 
441 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  57.11 
 
 
446 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  56.16 
 
 
441 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  56.16 
 
 
441 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  57.73 
 
 
434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  55.45 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  56.4 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  56.31 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  49.65 
 
 
427 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  47.89 
 
 
439 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 
432 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.76 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  44.8 
 
 
470 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  44.8 
 
 
470 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  43.69 
 
 
471 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  45.01 
 
 
481 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  44.57 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.88 
 
 
442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  45.39 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  44.78 
 
 
474 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.99 
 
 
441 aa  317  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  44.52 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  45.95 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 
468 aa  312  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  43.91 
 
 
470 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.62 
 
 
446 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  47.62 
 
 
442 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 
440 aa  298  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  45.43 
 
 
432 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  45.43 
 
 
432 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  45.43 
 
 
432 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.54 
 
 
442 aa  297  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.52 
 
 
468 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.33 
 
 
450 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.77 
 
 
437 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.23 
 
 
437 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.64 
 
 
437 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.81 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 
438 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.83 
 
 
439 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.26 
 
 
433 aa  285  9e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.44 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.95 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.95 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.95 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.61 
 
 
439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.29 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.34 
 
 
439 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.55 
 
 
439 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.55 
 
 
439 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 
431 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.55 
 
 
439 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 
461 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.18 
 
 
430 aa  279  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.81 
 
 
439 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>