More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2608 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
441 aa  861    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1014  major facilitator superfamily MFS_1  55.17 
 
 
444 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 
446 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  48.18 
 
 
433 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  48.48 
 
 
439 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 
432 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  47.13 
 
 
439 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  47.9 
 
 
439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  47.9 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  45.1 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  46.9 
 
 
439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  46.9 
 
 
439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  46.9 
 
 
439 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  46.67 
 
 
439 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  44.47 
 
 
427 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 
437 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  43.93 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  45.14 
 
 
434 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  43.2 
 
 
439 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  42.76 
 
 
437 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  44.18 
 
 
436 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  44.18 
 
 
436 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  46.33 
 
 
439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
444 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 
442 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  43.65 
 
 
436 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
444 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
444 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  43.03 
 
 
444 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
444 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
444 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  43.64 
 
 
433 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  43.92 
 
 
436 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  43.92 
 
 
436 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  42.76 
 
 
524 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.55 
 
 
437 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  41.3 
 
 
468 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 
431 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.08 
 
 
450 aa  322  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.4 
 
 
433 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  43.92 
 
 
436 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  45.24 
 
 
443 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  45.24 
 
 
443 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  44.25 
 
 
446 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  45.24 
 
 
443 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  45.24 
 
 
443 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.99 
 
 
437 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  44.99 
 
 
443 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  44.99 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  44.75 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  44.75 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  44.99 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  43.78 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  43.78 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  44.75 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  43.78 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  44.75 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  44.75 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  44.75 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  45.36 
 
 
439 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  44.5 
 
 
437 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  42.46 
 
 
430 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  42.59 
 
 
444 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.66 
 
 
438 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  42.59 
 
 
439 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  42.59 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  42.59 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  43.11 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  42.05 
 
 
457 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.85 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  42.36 
 
 
444 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  42.48 
 
 
439 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.82 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.25 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  41.59 
 
 
447 aa  306  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  43.56 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.72 
 
 
450 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.89 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.46 
 
 
439 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  43.17 
 
 
442 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 
461 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.93 
 
 
442 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.13 
 
 
435 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.21 
 
 
439 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.13 
 
 
435 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.13 
 
 
435 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
472 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  44.12 
 
 
438 aa  298  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.27 
 
 
439 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
435 aa  296  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
457 aa  296  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  45.36 
 
 
460 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39.38 
 
 
445 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  41.16 
 
 
446 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.48 
 
 
430 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.43 
 
 
442 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>