More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3004 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  86.75 
 
 		 443 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  86.75 
 
 		 443 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  86.75 
 
 		 443 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  86.75 
 
 		 443 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  82.68 
 
 		 443 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  86.51 
 
 		 443 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  859    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  86.51 
 
 		 443 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  98.17 
 
 		 437 aa  842    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  86.75 
 
 		 443 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  69.81 
 
 		 436 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  69.81 
 
 		 436 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  66.51 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  70.53 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  69.76 
 
 		 436 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  70 
 
 		 436 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  69.76 
 
 		 436 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  70.07 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  69.27 
 
 		 436 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  70.07 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  70.85 
 
 		 437 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  70.85 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  70.85 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  70.85 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  70.85 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  65.6 
 
 		 439 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  66.91 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  66.82 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  66.82 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  67.06 
 
 		 444 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  66.82 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  65.6 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  67.06 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  65.83 
 
 		 439 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  62.89 
 
 		 524 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  63.25 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  63.25 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  63.03 
 
 		 444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  63.44 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  63.25 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  63.25 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  63.25 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  59.18 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  58.45 
 
 		 441 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  58.45 
 
 		 441 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  57.97 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  58.7 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  57.97 
 
 		 441 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  58.25 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  58.21 
 
 		 441 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  58.21 
 
 		 441 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  51.67 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  49.77 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.18 
 
 		 433 aa  361  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 474 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 481 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  44.37 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 470 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 470 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.76 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 468 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  44.03 
 
 		 470 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.23 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.69 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  46.75 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  43.33 
 
 		 442 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.95 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.82 
 
 		 437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 442 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.56 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.79 
 
 		 446 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 439 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.67 
 
 		 438 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  40.65 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 461 aa  289  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  41.19 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>