More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2127 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  100 
 
 		 441 aa  870    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  64.8 
 
 		 442 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.27 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 435 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 435 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 435 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 442 aa  346  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 452 aa  329  7e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.17 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.24 
 
 		 455 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.03 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.89 
 
 		 441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  45.76 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  45.76 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  43.66 
 
 		 452 aa  323  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  45.28 
 
 		 483 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  45.28 
 
 		 436 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  45.28 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.57 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.33 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 		 435 aa  320  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  45.28 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  45.52 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.52 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  45.52 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.42 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  45.28 
 
 		 523 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.02 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.84 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  45.28 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  45.28 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  45.28 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.17 
 
 		 441 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.86 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.86 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.41 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 420 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 		 420 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  41.63 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.91 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  40.42 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.5 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  45.04 
 
 		 506 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.78 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 		 420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.29 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  41.06 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  41.06 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  41.06 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  43.93 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  40.61 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.39 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  44.31 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  44.31 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  44.31 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  41.18 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  44.31 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  44.31 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  42.79 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>