More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5847 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  100 
 
 
455 aa  909    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  83.52 
 
 
457 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  87.17 
 
 
456 aa  779    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  85.4 
 
 
454 aa  755    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  50.82 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 
440 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.94 
 
 
437 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 
461 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  47.02 
 
 
468 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  49.54 
 
 
461 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.42 
 
 
438 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  46.64 
 
 
455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  46.31 
 
 
439 aa  359  5e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  45.17 
 
 
460 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2535  major facilitator transporter  47.1 
 
 
439 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.1 
 
 
437 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.55 
 
 
439 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.16 
 
 
484 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.89 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.34 
 
 
461 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.34 
 
 
461 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.34 
 
 
461 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.26 
 
 
439 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  42.79 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.56 
 
 
439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.79 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.03 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.79 
 
 
439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.79 
 
 
439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 
442 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  43.69 
 
 
458 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.13 
 
 
446 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
438 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  43.15 
 
 
459 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.16 
 
 
433 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  42.75 
 
 
441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.84 
 
 
438 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  42.28 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.86 
 
 
447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  42.06 
 
 
459 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.18 
 
 
439 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  41.49 
 
 
450 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  42.36 
 
 
450 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.22 
 
 
435 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.22 
 
 
435 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.22 
 
 
435 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.94 
 
 
439 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.71 
 
 
439 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 
435 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  45.01 
 
 
443 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  43.02 
 
 
445 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  42.86 
 
 
459 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.8 
 
 
430 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  43.76 
 
 
460 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.79 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  44 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  44 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  43.06 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  43.06 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  43.06 
 
 
434 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  43.29 
 
 
460 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
433 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  43.06 
 
 
435 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  43.53 
 
 
445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  42.82 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  42.82 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 
436 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  41.3 
 
 
439 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.34 
 
 
430 aa  310  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  41.06 
 
 
437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.07 
 
 
445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  42.89 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  40.72 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  44.16 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.59 
 
 
436 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  40.48 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 
448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  44.63 
 
 
434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.82 
 
 
439 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 
454 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  42.3 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.69 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.29 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.5 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.95 
 
 
447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  43.82 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.22 
 
 
441 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  40.98 
 
 
435 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  46.74 
 
 
443 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 
444 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.7 
 
 
442 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.32 
 
 
457 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.38 
 
 
457 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.32 
 
 
457 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 
458 aa  299  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>