More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0094 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  84.88 
 
 
449 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  100 
 
 
443 aa  863    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  68.15 
 
 
444 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  71.49 
 
 
444 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  67.6 
 
 
466 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  65.65 
 
 
453 aa  511  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  65.09 
 
 
448 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  65.99 
 
 
463 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  45.9 
 
 
435 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  45.79 
 
 
439 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  45.9 
 
 
435 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  45.9 
 
 
435 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  47.54 
 
 
441 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  45.56 
 
 
439 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  47.96 
 
 
439 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  49.3 
 
 
460 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.33 
 
 
437 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  48.42 
 
 
439 aa  359  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  49.2 
 
 
442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 
435 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  48.81 
 
 
439 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  42.51 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.74 
 
 
456 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  42.69 
 
 
450 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  42.99 
 
 
461 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  42.99 
 
 
461 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  42.99 
 
 
461 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.73 
 
 
438 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  42.58 
 
 
447 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  40.6 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  40.61 
 
 
429 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  41.11 
 
 
459 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  44.57 
 
 
455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  41.35 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  40.62 
 
 
449 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.49 
 
 
468 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.56 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  44.55 
 
 
456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  44.8 
 
 
454 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  41.4 
 
 
442 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 
442 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  42.43 
 
 
443 aa  299  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
442 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  43.65 
 
 
427 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.88 
 
 
446 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.21 
 
 
457 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  39.09 
 
 
458 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 
432 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.21 
 
 
457 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43 
 
 
441 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.21 
 
 
457 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 
461 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.5 
 
 
430 aa  293  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.68 
 
 
450 aa  293  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  43.68 
 
 
439 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  43.68 
 
 
439 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  43.68 
 
 
439 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.05 
 
 
437 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  43.68 
 
 
457 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
465 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.05 
 
 
439 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.06 
 
 
439 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.47 
 
 
439 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  40.94 
 
 
439 aa  289  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  40.64 
 
 
439 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  40.64 
 
 
439 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  40.39 
 
 
439 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.05 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.96 
 
 
437 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
443 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  38.07 
 
 
433 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.39 
 
 
461 aa  285  9e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  40.19 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  40.45 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  41.83 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  41.22 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.21 
 
 
459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.21 
 
 
439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  41.87 
 
 
450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.24 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  41.05 
 
 
437 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  42.96 
 
 
432 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.16 
 
 
435 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
456 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  38.66 
 
 
463 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  42.96 
 
 
432 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  38.66 
 
 
463 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  38.66 
 
 
463 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  42.96 
 
 
432 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  38.64 
 
 
435 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40 
 
 
442 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  39.66 
 
 
436 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  38.64 
 
 
435 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.45 
 
 
443 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  37.94 
 
 
470 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  39.51 
 
 
460 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  38.52 
 
 
435 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>