More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2261 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  879    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  51.79 
 
 
439 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  51.42 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  51.42 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  51.42 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  51.82 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  51.79 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  50.98 
 
 
441 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 
435 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  48.06 
 
 
442 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  52 
 
 
439 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.7 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 
440 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  42.58 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  42.72 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 
444 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
449 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
444 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
466 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.76 
 
 
439 aa  280  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  39.16 
 
 
453 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.62 
 
 
430 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  43.51 
 
 
463 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  38.71 
 
 
441 aa  276  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  44.94 
 
 
443 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.51 
 
 
457 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.51 
 
 
457 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.51 
 
 
457 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  42.78 
 
 
438 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.28 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.52 
 
 
461 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.52 
 
 
461 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.52 
 
 
461 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  40.91 
 
 
441 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.72 
 
 
450 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.62 
 
 
441 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.78 
 
 
484 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.79 
 
 
439 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  37.09 
 
 
450 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  38.79 
 
 
439 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  38.28 
 
 
430 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.79 
 
 
439 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  39.25 
 
 
447 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.52 
 
 
439 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  37.27 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  38.52 
 
 
439 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.27 
 
 
456 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.98 
 
 
468 aa  259  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  38.52 
 
 
439 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  38.52 
 
 
439 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  34.92 
 
 
437 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
454 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  36.67 
 
 
459 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  38.42 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  38.11 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  37.91 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  40.35 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  40.35 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  36.62 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  37.73 
 
 
436 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  41.85 
 
 
427 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  40.35 
 
 
439 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  34.2 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  38.66 
 
 
443 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  36.62 
 
 
456 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  33.96 
 
 
438 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.96 
 
 
438 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  35.79 
 
 
455 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  37.44 
 
 
432 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  33.57 
 
 
458 aa  253  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  33.96 
 
 
438 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  37.44 
 
 
432 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  37.44 
 
 
432 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  33.96 
 
 
438 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  36.49 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  33.73 
 
 
438 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.25 
 
 
437 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  37.64 
 
 
461 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  33.96 
 
 
438 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  33.96 
 
 
438 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 
431 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  38.34 
 
 
433 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  38.59 
 
 
459 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.5 
 
 
437 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  35.28 
 
 
439 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.53 
 
 
438 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 
446 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 
435 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
438 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  40.23 
 
 
439 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  37.53 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  35.66 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.66 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  36.91 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  37.3 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  36.09 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  37.23 
 
 
444 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>