More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1044 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  865    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5957  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0570513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.23 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  41.53 
 
 		 439 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.19 
 
 		 459 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.63 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.63 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.63 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.21 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.77 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 439 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  37.38 
 
 		 484 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  39.01 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 459 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  39.76 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.2 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 448 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 439 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 433 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  38.55 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  37.71 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.92 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  35.06 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  38.59 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  39.2 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 446 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  40.29 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  38.73 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.98 
 
 		 447 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 457 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  41.11 
 
 		 438 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.6 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  40.24 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.35 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  36.58 
 
 		 443 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 453 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 466 aa  259  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  35.58 
 
 		 459 aa  259  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  38.64 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.05 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 460 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  38.13 
 
 		 439 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  37.41 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  37.7 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  38.1 
 
 		 435 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  37.43 
 
 		 435 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  37.43 
 
 		 435 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  36.59 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.15 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  36.71 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  40.43 
 
 		 482 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  37.43 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  37.43 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 436 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  38.74 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.29 
 
 		 437 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  39.9 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 442 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>