More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4875 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  79.95 
 
 
439 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
439 aa  858    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  99.54 
 
 
439 aa  855    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  100 
 
 
439 aa  858    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  66.21 
 
 
453 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  47.86 
 
 
445 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  47.12 
 
 
442 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  47.64 
 
 
452 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 
437 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  47.27 
 
 
435 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
458 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 
458 aa  342  8e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  46.7 
 
 
460 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  43.43 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.47 
 
 
436 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 
436 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.39 
 
 
430 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  45.63 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  45.22 
 
 
435 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  45.22 
 
 
435 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  45.22 
 
 
435 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  44.76 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  46.15 
 
 
434 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  43.27 
 
 
450 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  44.52 
 
 
439 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  44.52 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.5 
 
 
439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.89 
 
 
439 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.76 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.99 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.76 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.76 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.76 
 
 
439 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.14 
 
 
430 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.29 
 
 
437 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  46.19 
 
 
438 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.91 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.36 
 
 
439 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.96 
 
 
437 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.16 
 
 
437 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  42.28 
 
 
450 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.83 
 
 
446 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  44.6 
 
 
427 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  43.49 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 
449 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.03 
 
 
468 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.69 
 
 
441 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  45.86 
 
 
461 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
431 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.79 
 
 
441 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  42.34 
 
 
439 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 
454 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.77 
 
 
432 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.77 
 
 
432 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.77 
 
 
432 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  42.61 
 
 
435 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  45.24 
 
 
442 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  40.46 
 
 
439 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  41.4 
 
 
439 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 
446 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  41.18 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  40.43 
 
 
461 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  40.43 
 
 
461 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  40.43 
 
 
461 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  44.76 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  41.4 
 
 
482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 
448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.32 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.65 
 
 
441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  39.91 
 
 
455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  43.81 
 
 
443 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 
461 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.21 
 
 
439 aa  279  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 
456 aa  279  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.22 
 
 
456 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  38.92 
 
 
433 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  39.67 
 
 
434 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.47 
 
 
442 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.94 
 
 
447 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 
432 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  38.28 
 
 
437 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.43 
 
 
435 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.43 
 
 
435 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.9 
 
 
457 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  38.57 
 
 
449 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.9 
 
 
457 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.9 
 
 
457 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  38.57 
 
 
449 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  43.65 
 
 
524 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  39.06 
 
 
434 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  38.92 
 
 
433 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>