More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4283 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  100 
 
 		 460 aa  908    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  81.37 
 
 		 442 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  90.55 
 
 		 437 aa  754    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  68.76 
 
 		 458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  71.23 
 
 		 436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  70.99 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  68.88 
 
 		 434 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  65.57 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  63.88 
 
 		 450 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  64.22 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  64.56 
 
 		 434 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  62.68 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  58.33 
 
 		 457 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  56.42 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  51.24 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  47.86 
 
 		 433 aa  359  7e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  46.7 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 439 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 439 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  45.32 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  45.32 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.75 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  45.54 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.3 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.13 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.16 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  45.36 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  46.1 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.16 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 432 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 432 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 450 aa  320  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  47.91 
 
 		 432 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.39 
 
 		 468 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.87 
 
 		 456 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 438 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  45.39 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.61 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.55 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.77 
 
 		 438 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  40.47 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  39.86 
 
 		 430 aa  310  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.21 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  40.89 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  41.84 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  42.72 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  42.72 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  41.5 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.94 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  40.91 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.91 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  41.71 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  40.91 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  40.91 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.67 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  40.96 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.67 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  40.91 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  43.5 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  40.91 
 
 		 438 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.67 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  40.96 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  41.47 
 
 		 435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  41.47 
 
 		 435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>