More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4803 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
444 aa  860    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  70.11 
 
 
449 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  71.49 
 
 
443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  71.84 
 
 
466 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  67.27 
 
 
448 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  68.62 
 
 
453 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  68.99 
 
 
463 aa  532  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  62.95 
 
 
444 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  49.53 
 
 
439 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  50.12 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  50.12 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  50.12 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  51.12 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  49.88 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  49.29 
 
 
439 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  49.29 
 
 
439 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  49.52 
 
 
435 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.78 
 
 
437 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  50.88 
 
 
439 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 
440 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  44.97 
 
 
455 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  50 
 
 
439 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  47.58 
 
 
460 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  51.43 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  44.11 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  44.11 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  44.11 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.67 
 
 
456 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 
442 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  44.19 
 
 
447 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  43.37 
 
 
450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  45.59 
 
 
443 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.41 
 
 
457 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46.14 
 
 
461 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.41 
 
 
457 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.41 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.55 
 
 
484 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  43.12 
 
 
429 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  43.5 
 
 
430 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  43.65 
 
 
442 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  43.02 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.86 
 
 
468 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
431 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  40.43 
 
 
439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  45.25 
 
 
455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  46.21 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  38.8 
 
 
458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  43.64 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  40.95 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  45.66 
 
 
441 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.36 
 
 
450 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  41.67 
 
 
433 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.92 
 
 
430 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  44.09 
 
 
454 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.53 
 
 
482 aa  299  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  41.84 
 
 
459 aa  299  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 
465 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.35 
 
 
439 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.58 
 
 
439 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  37.75 
 
 
459 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.75 
 
 
441 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
442 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.38 
 
 
447 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.29 
 
 
441 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
435 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.07 
 
 
433 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 
461 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  43.56 
 
 
427 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.69 
 
 
446 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  45.7 
 
 
432 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.21 
 
 
439 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  45.7 
 
 
432 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  45.7 
 
 
432 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.96 
 
 
439 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.46 
 
 
439 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.71 
 
 
439 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.71 
 
 
439 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  41.88 
 
 
445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  42.89 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.46 
 
 
439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.29 
 
 
443 aa  289  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  38.34 
 
 
459 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  41.01 
 
 
442 aa  289  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  41.25 
 
 
463 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.8 
 
 
437 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.92 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  37.88 
 
 
459 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  39.76 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  42.86 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  38.19 
 
 
482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  44.18 
 
 
457 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
452 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  40.19 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  40.19 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  40.19 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
443 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.58 
 
 
436 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  43 
 
 
434 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.8 
 
 
437 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  39.59 
 
 
452 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>