More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7098 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  83.48 
 
 
457 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  96.27 
 
 
454 aa  839    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  100 
 
 
456 aa  907    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  87.17 
 
 
455 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
431 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  52.31 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  47.93 
 
 
461 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  51.76 
 
 
437 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  49.19 
 
 
438 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  45.65 
 
 
468 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  47.77 
 
 
439 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  48.16 
 
 
461 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2535  major facilitator transporter  47.56 
 
 
439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  45.45 
 
 
455 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.44 
 
 
460 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.42 
 
 
484 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.4 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.57 
 
 
461 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.57 
 
 
461 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.57 
 
 
461 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.81 
 
 
437 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.85 
 
 
456 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.96 
 
 
437 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.4 
 
 
433 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 
442 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.4 
 
 
439 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.75 
 
 
441 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.61 
 
 
435 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.61 
 
 
435 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.61 
 
 
435 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.4 
 
 
439 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  41.84 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.22 
 
 
439 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  41.59 
 
 
459 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41.61 
 
 
439 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.65 
 
 
439 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  41.07 
 
 
450 aa  325  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.65 
 
 
439 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.65 
 
 
439 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.13 
 
 
439 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  41.14 
 
 
459 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.29 
 
 
458 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 
438 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.94 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.87 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  40.62 
 
 
459 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  44.15 
 
 
445 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.33 
 
 
446 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.5 
 
 
450 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  43.68 
 
 
460 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  42.23 
 
 
439 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.32 
 
 
439 aa  315  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.68 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.44 
 
 
445 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.09 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.44 
 
 
445 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 
448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  40.47 
 
 
430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  41.16 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
465 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  40.72 
 
 
442 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.47 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  43.2 
 
 
445 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  43.02 
 
 
443 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 
446 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  41.14 
 
 
459 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  45.07 
 
 
453 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.72 
 
 
457 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.16 
 
 
441 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.72 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.72 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  41.4 
 
 
433 aa  309  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  44.63 
 
 
452 aa  309  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  39.81 
 
 
447 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  41.59 
 
 
460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  42.58 
 
 
435 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.96 
 
 
442 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.87 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  42.11 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  42.11 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  42.11 
 
 
434 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
437 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 
466 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  42.45 
 
 
435 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  41.87 
 
 
435 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  41.87 
 
 
435 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  41.63 
 
 
437 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  44.15 
 
 
434 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.98 
 
 
441 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.09 
 
 
443 aa  300  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 
437 aa  299  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  39.14 
 
 
442 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  43.07 
 
 
445 aa  299  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40.74 
 
 
441 aa  298  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  40.79 
 
 
435 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.57 
 
 
430 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>