More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0374 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  829    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  57.55 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  46.02 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.1 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  46.21 
 
 		 447 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 439 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  47.86 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.48 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  48.07 
 
 		 460 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 445 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.88 
 
 		 430 aa  333  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  44.81 
 
 		 482 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  46.32 
 
 		 446 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  45.56 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  46.42 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.09 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  42.73 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.81 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  45.48 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 450 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.43 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  48.47 
 
 		 452 aa  322  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.4 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.46 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  43.81 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  44.76 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  43.57 
 
 		 438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  41.9 
 
 		 461 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  41.9 
 
 		 461 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  41.9 
 
 		 461 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  43.57 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  43.57 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 465 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.34 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.44 
 
 		 452 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  43.57 
 
 		 438 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  43.33 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.33 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  43.33 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  43.45 
 
 		 460 aa  316  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 432 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  45.76 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  46.14 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  45.19 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  46.45 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  43.69 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  44.95 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 445 aa  312  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.82 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.13 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  45.1 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  45.59 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  45.1 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  45.61 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 450 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 472 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  45.34 
 
 		 435 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  45.34 
 
 		 435 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  46.06 
 
 		 427 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>