More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1778 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  873    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  54.03 
 
 		 445 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  55.51 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  53.86 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  57.78 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  51.24 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  52.18 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  49.76 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 450 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  49.08 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  53.1 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.91 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  47.64 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.8 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.47 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  48.93 
 
 		 461 aa  362  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 451 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  46.79 
 
 		 430 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.72 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.72 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.72 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  43.35 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  47.41 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  48.47 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 458 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  45.15 
 
 		 449 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  45.37 
 
 		 449 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  44.12 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  47.09 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  45.65 
 
 		 455 aa  349  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  43.02 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  47.39 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  44.19 
 
 		 447 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  41.93 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  48.05 
 
 		 438 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  46.44 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  44.42 
 
 		 482 aa  335  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  44.66 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  42 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  44.17 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  44.52 
 
 		 443 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  45.58 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  44.1 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  44.42 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  44.42 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  47.04 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  43.61 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  49.49 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  47 
 
 		 454 aa  329  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  45.54 
 
 		 439 aa  329  8e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  46.17 
 
 		 460 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  43.33 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  43.33 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 439 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  43.18 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  43.43 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.91 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  44.42 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 446 aa  322  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 457 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>