More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1456 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1456  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  875    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 439 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 439 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  65.91 
 
 		 439 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  66.2 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  48.2 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 452 aa  360  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  47 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.6 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2004  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4527  major facilitator transporter  48 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  46.45 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 457 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.48 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  43.89 
 
 		 430 aa  312  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.3 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 439 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 439 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 439 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 439 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 440 aa  302  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.78 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  43.42 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.22 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 439 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 454 aa  296  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  44.29 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 439 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.11 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.1 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.12 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.86 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 437 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.48 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  39.57 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  39.57 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  39.57 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  39.68 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  38.44 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  40.38 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.19 
 
 		 435 aa  279  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  40.44 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  39.64 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  36.95 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  40.41 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.57 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.37 
 
 		 447 aa  276  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 456 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  37.36 
 
 		 484 aa  275  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  40.27 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  40.27 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  40.86 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.95 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  40.46 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  40.14 
 
 		 434 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.22 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.22 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 436 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>