More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3443 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  98.18 
 
 		 439 aa  863    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  97.49 
 
 		 439 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  72.18 
 
 		 437 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  75.86 
 
 		 437 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  98.41 
 
 		 439 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  99.54 
 
 		 439 aa  869    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  874    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  96.35 
 
 		 439 aa  843    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  98.41 
 
 		 439 aa  864    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  49.88 
 
 		 409 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  48.43 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 461 aa  358  9e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  47.9 
 
 		 441 aa  346  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  45.19 
 
 		 435 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  45.19 
 
 		 435 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  42.86 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  41.41 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  44.55 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  44.55 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  44.95 
 
 		 435 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  44.09 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  44.32 
 
 		 439 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.11 
 
 		 468 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  44.62 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  44.55 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  43.38 
 
 		 430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  41.51 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 450 aa  338  9e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 452 aa  338  9e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.53 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  43.41 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 440 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  43.1 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.3 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 439 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  44.01 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.01 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  44.01 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  44.01 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  44.01 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  44.01 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  44.01 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  43.77 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 442 aa  329  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  47.15 
 
 		 436 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.44 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  45.8 
 
 		 438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  44.97 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.15 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.15 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.15 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 435 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  45.5 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  43.1 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.69 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  47.29 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  43.97 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.44 
 
 		 438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 455 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.8 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 445 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  42.09 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.93 
 
 		 447 aa  316  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 442 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 		 432 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  41.75 
 
 		 447 aa  315  9e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>